hswmzp 写了： 2022年 11月 3日 18:47 蛋白结构通常分为四级结构
一级结构就是测序，那些氨基酸组成
二级结构就是几条链组成，一个蛋白通常像一堆烂麻线
通过变性可以让麻线理顺撸直了，知道是几根
这些早研究很清楚了，但是这些都是死的，弄清楚了也不知道它咋工作的
三结构四级结构才是立体的，这些蛋白起活性的时候的
但是活体内，这些构象是每秒钟都在变
而且活性位点比如酶作用的位点或者药物作用位点通常在这团烂麻线内部。
学物理索南知道疏水清水原理这个不用多说了吧
能教授和一共拍裸照用电镜，必须要把样品固定
也就是把蛋白弄死，你看到的就是某个瞬间的静态照片
毛用没有
更大挑战是，这些活蛋白不可能直接从人体上面取得，通常要用模式表达系统比如大肠杆菌或者酵母来产生大量的活性蛋白
这和真实场景有差了n条街了
所以她这种抓拍的裸照某种程度上就是盲人摸象，还是大象模型
根本没屌用，某种意义上不如AI预测
蛋白质folding的复杂性
版主： Caravel， TheMatrix， molen
蛋白质folding的复杂性
上次由 TheMatrix2 在 2022年 11月 3日 21:31 修改。
Re: 蛋白质folding的复杂性
Amorphous 写了： 2022年 11月 3日 21:00
蛋白质折叠的关键是多尺度多物理
多种相互作用，从化学到物理，离子到共价，分子到电解质，能量尺度从几十电子伏特到毫电子伏特，时间尺度从飞秒到毫秒，空间尺度从皮米到微米。这样的模拟，要从第一性原理做出来普适的方法，比原子弹爆炸还要挑战。
