麻痹的徐锦波的ultra deep learning模型绝对是alphafold的prior art

[superdsb]

即使炸药奖给alphafold
麻痹的claim credit也需要合理划定
说获奖贡献是因ML预测蛋白结构 明显范围太大了 名不符实
白皮真几把阴逼 对不对 钱老僵菌们？

[英亲王阿齐格]

还得看预测效果吧

[rihai]

卧槽， 徐锦江还会ML?
dundundun

即使炸药奖给alphafold
麻痹的claim credit也需要合理划定
说获奖贡献是因ML预测蛋白结构 明显范围太大了 名不符实
白皮真几把阴逼 对不对 钱老僵菌们？

[行观曰]

还得看预测效果吧

原理已经走通了

viewtopic.php?t=611526

他当时应该去找算力最大的公司，而不是在学术界瞎BB去给讲座

[superdsb]

徐锦波文章里说了啊
比CASP11的winner强太多了

还得看预测效果吧

[英亲王阿齐格]

原理已经走通了

他当时应该去找算力最大的公司，而不是在学术界瞎BB去给讲座

什么叫原理已经走通了？
是alphafold走通的 好不好

你预测了半天 预测不对，怎么叫原理走通啊

[行观曰]

什么叫原理已经走通了？
是alphafold走通的 好不好

你预测了半天 预测不对，怎么叫原理走通啊

viewtopic.php?t=611526

下面 Xu jinbo 他本人的回复：

其实John Jumper是我在芝加哥大学两位合作教授（Tobin Sosnick, Karl Freed) 的学生，我2016年秋天在我们研究所讲我的工作，告诉大家用AI 可以大幅度提高蛋白质结构预测精度，Tobin 和 他几个学生包括 John Jumper都在，事后 John也跟我的博士后做了几次交流。几个月之后，John去了DeepMind。

[rihai]

为啥被古狗摘桃子了？
你展开谈谈
吨吨吨

徐锦波文章里说了啊
比CASP11的winner强太多了

[行观曰]

为啥被古狗摘桃子了？
你展开谈谈
吨吨吨

原理已经走通了

viewtopic.php?t=611526

他当时应该去找算力最大的公司，而不是在学术界瞎BB去给讲座

[superdsb]

上面说了
黄皮就喜欢在学术圈瞎几把混
这种明显算力决定一切的idea当然要到业界去开发才跟得上
不过黄皮还是比较难 很少有大公司愿意跟黄皮叫兽合作吧

为啥被古狗摘桃子了？
你展开谈谈
吨吨吨

[rihai]

这有啥原理的
当时谁都在找深学能用的地方， 蛋白结构预测显然是人人都想到了的可以应用的地方
叔觉得还是要内行比较一下徐锦江的方法和古狗的异同
也许用的features完全不一样
当然， 如果古狗只是数据集大算力大， 那完全不该颁给古狗而是徐锦江
吨吨吨

原理已经走通了

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他当时应该去找算力最大的公司，而不是在学术界瞎BB去给讲座

[行观曰]

这有啥原理的
当时谁都在找深学能用的地方， 蛋白结构预测显然是人人都想到了的可以应用的地方
叔觉得还是要内行比较一下徐锦江的方法和古狗的异同
也许用的features完全不一样
当然， 如果古狗只是数据集大算力大， 那完全不该颁给古狗而是徐锦江
吨吨吨

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下面 Xu jinbo 他本人的回复：

其实John Jumper是我在芝加哥大学两位合作教授（Tobin Sosnick, Karl Freed) 的学生，我2016年秋天在我们研究所讲我的工作，告诉大家用AI 可以大幅度提高蛋白质结构预测精度，Tobin 和 他几个学生包括 John Jumper都在，事后 John也跟我的博士后做了几次交流。几个月之后，John去了DeepMind。

[英亲王阿齐格]

viewtopic.php?t=611526

下面 Xu jinbo 他本人的回复：

其实John Jumper是我在芝加哥大学两位合作教授（Tobin Sosnick, Karl Freed) 的学生，我2016年秋天在我们研究所讲我的工作，告诉大家用AI 可以大幅度提高蛋白质结构预测精度，Tobin 和 他几个学生包括 John Jumper都在，事后 John也跟我的博士后做了几次交流。几个月之后，John去了DeepMind。

你看paper了吗？

我粗略扫了一眼，首先他用的是卷积网络， 当图像识别那样 识别蛋白质序列。 这个跟alphafold不一样的， alphafold的网络是独特，是自己搞得。

这个xu，你去看他的publication，都是做蛋白质模拟的，什么方法火用什么。

[英亲王阿齐格]

而且他只预测了几百个蛋白质把

跟alphafold那种预测了几乎所有的，还是不一样的，alphafold的论文你看了吗？ 你但凡看过 就不会觉得 ，跟徐有什么关系。 alphafold的网络用的是 attention，所以他叫evoformer（这个显然是取了transformer，外加evolution）

[行观曰]

你看paper了吗？

我粗略扫了一眼，首先他用的是卷积网络， 当图像识别那样 识别蛋白质序列。 这个跟alphafold不一样的， alphafold的网络是独特，是自己搞得。

这个xu，你去看他的publication，都是做蛋白质模拟的，什么方法火用什么。

诺贝尔一直标榜奖励的原创性，

徐是第一个人明确“告诉大家用AI 可以大幅度提高蛋白质结构预测精度”

后面跟上的人属于技术改进

[superdsb]

属实
要是按照专利法
麻痹后面的alphafold都有侵权嫌疑

诺贝尔一直标榜奖励的原创性，

徐是第一个人明确“告诉大家用AI 可以大幅度提高蛋白质结构预测精度”

后面跟上的人属于技术改进

[rihai]

这个在专利法上属于“显然”的东西， 不具有保护价值
还是那句话
“叔觉得还是要内行比较一下徐锦江的方法和古狗的异同
也许用的features完全不一样”

诺贝尔一直标榜奖励的原创性，

徐是第一个人明确“告诉大家用AI 可以大幅度提高蛋白质结构预测精度”

后面跟上的人属于技术改进

[英亲王阿齐格]

诺贝尔一直标榜奖励的原创性，

徐是第一个人明确“告诉大家用AI 可以大幅度提高蛋白质结构预测精度”

后面跟上的人属于技术改进

我可以跟你说
用神经网络搞蛋白质预测的 绝不是这个xu第一个提出来的

不信你去搜搜文献。

[英亲王阿齐格]

诺贝尔一直标榜奖励的原创性，

徐是第一个人明确“告诉大家用AI 可以大幅度提高蛋白质结构预测精度”

后面跟上的人属于技术改进

Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol
. 1993:1:402-10.
Protein structure prediction system based on artificial neural networks

[行观曰]

Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol
. 1993:1:402-10.
Protein structure prediction system based on artificial neural networks

“告诉大家用AI 可以大幅度提高蛋白质结构预测精度”

而且 John Jumper 是听了徐的讲座的，还和他的博士后有交流